Если вы установили программу в DropBox которая одновременно работает на нескольких компьютерах, то будьте готовы к появлению кучи conflict файлов.

Однако в наше время многопользовательский софт необходим, а писать его используя какие-то сайты — крайне неудобно. Для версионности конечно же правильнее всего использовать различные GitHub а для решения простых многопользовательских задач нужно уяснить одно простое правило:

Два пользователя не должны писать в один файл.

Соблюдая это простое правило у вас никогда не появится конфликтных версий в DropBox, а значит все ваши данные останутся в целости.